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一、 開機
連接電源線后，打開機器后部的主開關（在機器的左下角）。開機后機器進行自檢“Self Test”，自檢結束后出現用戶主界面，顯示加熱模塊“Block”格式和溫度“Temp”和熱蓋溫度“Lid”，在屏幕左上角顯示“Ready”。
二、 程序設置
1.建立新程序
按“File”→“New”→“Program”，進入一個編輯窗口輸入程序名稱按
“Enter”鍵確認，之后進入程序編輯器；在“Header”中設置熱蓋的參數，輸入溫度和壓力，溫度默認值為96℃，一般設置為99℃，如變性溫度較低時默認值也可以滿足使用要求，壓力默認值為90N。
按“Step”設置PCR循環在“Temp”中輸入溫度后按“Enter”， “Time”中輸入時間按“Enter”，依次編輯步驟。輸入 “Goto”要返回的步驟序號，形成PCR循環，輸入循環數。 2.編輯模板程序
按“File”→“Edit”→“Program”，進入編輯窗口后按“Edit”鍵開始修改程序，修改完畢后按“Save”鍵保存后關閉該窗口返回主界面。
三、 運行程序
程序設置好后，按“Run”+“Start”，打開一個子窗口選擇要運行的程序（后一次修改的程序將自動被選中），確認選擇的程序后按“Start Now”開始運行程序。
四、 暫停與終止
如果要暫停或終止正在運行的程序，按“Run”+“Pause”或“Run”+“Stop now”，暫停后要繼續原來的程序按“Run”+“Continue”。
五、 關機
程序運行結束后，界面返回至主菜單。關閉儀器后部的主開關。
